ハワイアンドリームデモ

Javascriptが無効なため一部の機能が動作しません。動作させるためにはJavascriptを有効にしてください。またはブラウザの機能をご利用ください。 メインメニューをスキップして本文へ移動 交通・キャンパスマップ サイトマップ お問合せ 非常時の対応 当センターの概要 教育部門 研究部門 メンバー 活動情報 計算機環境 文理融合AI･データサイエンスセンター（AI-DS） 計算機環境 ページの本文です。 計算機環境 もくじ お知らせ スパコン「茶園」システム紹介 利用案内 茶園を利用した授業科目 研究成果 名称の由来・ロゴ紹介・管理チームの紹介 お問い合わせ先 お知らせ 2024年2月14日　研究成果を更新しました。 2022年8月10日　研究成果を更新しました。 2022年5月18日 「茶園を利用した授業科目」を追記しました。 2022年3月31日 ホームページをリニューアルしました。 スパコン「茶園」システム紹介 構成図 システム仕様 ハードウェア 計算クラスタ 機種名 FUJITSU Server PRIMEHPC FX700 総ノード数 4 CPU PRIMEHPC FX700サーバユニット(1.8GHz) Armv8.2-A SVE 48 コア 総理論演算性能 2.7648 TFLOPS /ノード(理論倍精度) 総主記憶容量 32 GiB(HBM2、4スタック)/ノード 機種名 FUJITSU Server PRIMERGY RX2540 M5 総ノード数 4 CPU Intel Xeon Gold 6240 プロセッサー(2.60GHz、18コア、24.8MB)×2 GPU NVIDIA Tesla V100S 32GB（PCIe） 総理論演算性能 44.7808 TFLOPS/4ノード (GPU含む理論倍精度) 総主記憶容量 384GB (96GB/1ノード) 計算クラスタ管理サーバ 機種名 FUJITSU Server PRIMERGY RX1330 M4 役割 システム管理・FX700ノード管理 フロントエンドサーバ 機種名 FUJITSU Server PRIMERGY RX2540 M5 役割 ワークフロー管理・データ解析(MATLAB) ユーザーシステム管理サーバ 機種名 FUJITSU Server PRIMERGY RX2530 M5 役割 ユーザ管理・バックアップ管理 共有ディスク装置 ストレージ装置 ETERNUS DX100 S5 搭載ディスク 16TB/7.2krpm 3.5インチ ニアラインSASディスクドライブ 物量容量 11,440TB 実効容量 1069TB ソフトウェア AI モデルソフトウェア MathWorks MATLAB 統計ソフトウェア IBM SPSS Statistics Base ##オプションは入っていません 計算化学ソフトウェア Gaussian 利用案内 本システムは学内関係者のみ使用が可能です。利用資格などは内部ページ（学内者のみ）（新しいウインドウが開きます）をご覧ください。 茶園を利用した授業科目 コンピュータビジョン 生命情報学演習 分子遺伝学実習 生物学実習2 予測生物学 研究成果 茶園を利用した際には 本システムを使った研究成果を論文等で発表する際には、謝辞等に本システムを利用した旨を明記するようにお願いします。謝辞の記載は以下を参照して下さい。 日本語 本研究における計算［の一部］は、お茶の水女子大学文理融合AI・データサイエンスセンター設置のスーパーコンピュータChaenで実施しました。 English The calculation in this research was [partially] conducted on Chaen, the supercomputer of the Center for Interdisciplinary AI and Data Science at Ochanomizu University. 茶園を利用した研究成果の論文 Mayu Shibata, Xingcheng Lin, José N. Onuchic, Kei Yura, Ryan R. Cheng (2024) Residue coevolution and mutational landscape for OmpR and NarL response regulator subfamilies. Biophysical Journal, doi:https://doi.org/10.1016/j.bpj.2024.01.028 Atsushi Hijikata, Tairo Oshima, Kei Yura, Yoshitaka Bessho (2023) ThermusQ: Toward the cell simulation platform for Thermus thermophilus, The Journal of General and Applied Microbiology.69, 59–67, https://doi.org/10.2323/jgam.2023.07.001 Kosuke Kataoka, Yuki Togawa, Ryuto Sanno, Toru Asahi, Kei Yura (2022) Dissecting Cricket Genomes for Advancement of Entomology and Entomophagy. Biophysical Reviews, 14, 75-97. doi:10.1007/s12551-021-00924-4. Ha T. T. Duong, Hirofumi Suzuki, Saki Katagiri, Mayu Shibata, Misae Arai, Kei Yura (2022) Computational study of the impact of nucleotide variations on highly conserved proteins: In the case of actin. Biophysics and Physicobiology, 19, e190025. 名称の由来・ロゴ紹介・管理チームの紹介 名称の由来 お茶大のユーザーの集まりをイメージするとともに、富士山（富岳） の麓にある茶畑をイメージしてChaen(茶園）と名付けました。 ロゴ紹介 「茶園」ロゴマークは、茶の葉をベースに白黒で作成することで、背景の色が暗い場合は白黒反転させることで汎用性を持たせています。また、文字は日本らしさと女性の柔らかさを意識したフォントを使用し、反射を入れることでお茶の水らしさを演出しています。 管理チーム Charls の紹介 本システムは、博士前期・後期課程の学生を中心としたCharlsが管理を行っています。Charlsは、お茶大の女子学生(Ocha+girls）を組み合わせて名づけました。 お問い合わせ先 Charls管理チーム Email:[email protected] 計算機環境 計算機環境 理学部 数理・データサイエンス教育 情報セキュリティポリシー 電力使用状況 教職員メニュー このサイトについて ソーシャルメディアポリシー 個人情報について プライバシーポリシー アクセスマップ サイトマップ お問い合わせ 国立大学法人お茶の水女子大学 〒112-8610 東京都文京区大塚2-1-1 責任者：お茶の水女子大学ホームページ運営委員会委員長 E-mail：&＃105;&＃110;&＃102;&＃111;&＃64;&＃99;&＃99;&＃46;&＃111;&＃99;&＃104;&＃97;&＃46;&＃97;&＃99;&＃46;&＃106;&＃112; PC表示 スマホ表示 Copyright © OCHANOMIZU UNIVERSITY. All rights reserved.